یکی دیگر از جاذبه های شهر یزد چشمه آب گرم مرتضی علی میباشد که در طبس قرار گرفته است .

زیبایی چشمه مرتضی علی به این است که در دل کویر 2 چشمه آب گرم و سرد کنار هم قرار گرفته است که منظره ایی حیرت انگیز ایجاد کرده است. .این چشمه مبدا آبی اغلب مزارع و تامین آب باغات طبس می‌باشد که از طریق نهر آبی به این شهر منتقل می‌شود.

چشمه آب گرم مرتضی علی طبس از مناطق طبیعی میباشد که با داشتن چشمه‌های آب درمانی به لحاظ توریست درمانی مورد توجه ویژه قرار گرفته است. گردشگران خارجی وداخلی  از این مناطق که طبیعت زیبایی نیز دارد استقبال می‌کنند.آب گرم چشمه از دیواره سمت راست به داخل رودخانه می‌ریزد و همین، اختلاف دمایی را در چشمه ایجاد می کند که گاهی به 10درجه هم می رسد.
آب گرم غلظت بیشتری دارد و تفاوت ساختاری آن با آب سرد جاری در کف رودخانه باعث می‌شود که این آب‌ها تا مسافت حدود 300 متری بستر رودخانه هم پیش بروند، در حالی که به طور کامل با هم مخلوط نشده‌اند و در بستر رودخانه قابل تفکیک هستندو اینکه میتوان یک پا را در آب سر قرار داد و یک پا را در آب گرم گذاشت.